毕达哥拉斯开启了早期希腊哲学的南意大利传统，他和他的学派在西方科学思想史和哲学史上都占有很重要的地位。
由于这个学派在数学上的重大研究成果，使希腊早期科学思想被推进到一种较高的抽象的逻辑思维水平。与此相关萌发了一种数理天文学思想。后来在希腊化时期得到充分发展。他们在数理科学上的杰出成就在科学史上有开创性价值。正是基于这种数学研究，毕达哥拉斯及其学派主张数为万物本原（原理）的哲学，和处于东部小亚细亚殖民城邦的凭借观察经验在具体物质中探求世界本原的伊奥尼亚传统相对应，在西部南意大利的希腊殖民城邦创始了另一种哲学传统，就是更注重以理性的逻辑思维去把握万物与宇宙的内在本性或本质。他们理解的本原已不是万物生于斯、复归于斯的某种具体物质，不是本原通过物态变化衍生万物，而是事物与世界内在固有的一种原理（principle，或译"原则"，但不如译"原理"更切合其哲学）。毕达哥拉斯及其学派认为这种本原即原理是万物和世界内在固有的、体现空间几何形式结构的数，是这种"几何数"决定和支配了万物的运变、规定性以及世界的结构与秩序，并力图用这种数的哲学来解释伦理与社会生活。稍后的爱利亚学派正是凭借更高度的哲学抽象，超越了毕达哥拉斯及其学派只从数量关系与空间形式结构寻求本原或原理的传统，强调靠理智的思维去把握全部自然即世界全体的普遍本质——"存在"（being）。毕达哥拉斯及其学派又往往蒙在一种神秘的宗教迷雾中，他们的科学与哲学思想是和有所改造的奥菲斯教教义交织在一起的，既和这种宗教有虚幻而似密切的思想联系，又在实质上用他们的哲学与科学思想来赋予奥菲斯教教义理性的成分，开始将它往理性神学方向提升。这也是他们开创的南意大利哲学传统的又一思想特色。
毕达哥拉斯学派在古希腊罗马哲学中是存在时间最长的一个哲学流派，从公元前6世纪末直至公元3世纪的古罗马时期，几乎长达800年之久。大体可分前后两个时期：前期是从公元前6世纪末到公元前4世纪上半叶，贯穿希腊古典文明时期，直到柏拉图时期，大体围绕毕达哥拉斯学说特别是其科学含义方面演进；后期是在希腊化和罗马时期，先在亚历山大里亚和柏拉图学园派内部生存，后是公元1世纪兴起新毕达哥拉斯学派，最后融入新柏拉图主义，其特征是和东方各种宗教思想混合，强化了神秘主义内涵。毕达哥拉斯学派的具有科学与宗教双重特性的哲学，对古希腊罗马哲学的影响很是深远，不可小看。它直接导生了早期希腊哲学中的南意大利传统，对紧接着的恩培多克勒和德谟克利特的哲学有不同的影响；它对柏拉图及其学园派的学说也有多种影响；在晚期希腊与罗马哲学中，新毕达哥拉斯主义也是当时折中主义和新柏拉图主义的重要思想构成部分。
本章只论述毕达哥拉斯及其前期学派。由于这一学派有神秘性，直接资料甚少，毕达哥拉斯和其学派的学说界限又不分明，学派内部的思想差异也很多，所以历来哲学史家都觉得对他们的研究很有难度。虽然有的问题难以完全澄明，但对这一学派的基本哲学理论及其历史价值还是可以作出明确论评，并在某些问题上作出更深入、合理的解释的。
